Βάζουμε το νερό σε μια κατσαρόλα μεσαίου μεγέθους και το φέρνουμε σε βρασμό. Ελαττώνουμε τη θερμοκρασία και προσθέτουμε σταδιακά το καλαμποκάλευρο, ανακατεύοντας συνεχώς με το σύρμα.
Μόλις πυκνώσει το μίγμα το αποσύρουμε από τη φωτιά. Ρίχνουμε την παρμεζάνα και το μοσχοκάρυδο και νοστιμίζουμε με αλάτι και πιπέρι.
Προθερμαίνουμε το φούρνο μας στους 180 βαθμούς με αντιστάσεις και βουτυρώνουμε καλά τα σκεύη που θα χρησιμοποιήσουμε.
Ρίχνουμε περίπου 2 κουταλιές από την πολέντα σε κάθε ραμεκέν και με το χέρι μας την πιέζουμε απαλά, να πλατύνει και να ισιώσει η επιφάνεια της.
Απλώνουμε από πάνω τις μισές πιπεριές. Στη συνέχεια ρίχνουμε τη μισή ποσότητα από τα ντοματίνια καθώς και τα μισά μανιτάρια.
Πασπαλίζουμε με το τυρί γκούντα και συνεχίζουμε με ακόμα μία στρώση από πιπεριές. Ρίχνουμε τα υπόλοιπα ντοματίνια και μανιτάρια και πασπαλίζουμε την επιφάνεια με το έμμενταλ.
Τέλος ρίχνουμε τη ρίγανη.
Ψήνουμε την πίτσα για 35-40', μέχρι να λιώσει το τυρί και να μαλακώσουν τα λαχανικά.
Σημειώσεις
Χρησιμοποίησα 2 μεγαλύτερα ατομικά σκεύη και 1 στρογγυλό πυρέξ με διάμετρο 24 εκ.